Con un analisi piu' approfondita ho verificato che:
Il pin 7 dell'integrato L4960 genera un alimentazione che serve al connettore esterno per il lokmouse. Quindi picche.
L'alimentazione da 5.4V per le tre schede dell'intellibox e' generato dal dc/dc converter KA34063A che avendo il limitatore in corrente interno ed essendo una delle schede in cortocircuito, non generava i 5.4V necessari.
Una volta trovata la scheda in corto (quella in cui sono presenti tutti i connettori di inp/out) ho trovato anche l'integrato in corto 74HC14 (ce ne sono due nel mio caso quello vicino all'hc244).
Ma una volta tolto il 74HC14 dalla scheda, ugualmente il dc/dc non riusciva a fornire i volt necessari

, ma questo perche' tramite il micro a bordo della stessa scheda una volta partito toglieva l'alimentazione.
Questo molto probabilmente per il fatto che un pin del 74HC14 era collegato al micro che non sentendo un segnale corretto agiva sul dc/dc converter togliendo l'alimentazione.
Insomma grazie a tutti e spero a mia volta di poter essere utile ad altri.
Che bello vederla funzionare.
Ora mettero' un bel tappo sul connettore s88.
Bye Bye Manuele